精氨酸甲基轉移酶(protein arginine methyltransferase, PRMT)家族蛋白及其介導的精氨酸甲基化修飾與癌癥的發生發展密切相關。PRMT主要有9個成員:PRMT1到9。精氨酸甲基化修飾分為單甲基化、對稱性雙甲基化和非對稱性雙甲基化修飾。PRMT家族成員依據其催化的精氨酸甲基化修飾分為I,II,III三型,其中I型包括PRMT1,2,3,4,6和8,能催化單甲基化和非對稱雙甲基化;II型包括PRMT5和9,能催化單甲基化和對稱雙甲基化;III型的PRMT7只能催化單甲基化。大量研究報道了I型和II型PRMT的甲基化修飾底物的鑒定,但唯一一個III型PRMT 成員PRMT7的底物及其與I型和II型PRMT的底物的關系仍是未知。
研究團隊利用高分辨率質譜系統地鑒定了細胞中PRMT7的精氨酸甲基化底物(甲基組,methylome),并與PRMT4和PRMT5的底物進行了比較分析,首次揭示了I型、II型和 III型PRMT介導的甲基化修飾網絡。基于所鑒定到的甲基化底物,研究團隊集中研究PRMT4,5和7協同甲基化修飾RNA剪接因子hnRNPA1從而調控癌癥相關基因剪接和促癌的功能和分子機制。
首先,研究團隊系統鑒定了蛋白質組中PRMT7調控的精氨酸甲基化位點并揭示其介導的甲基化修飾的特征:PRMT7偏向于甲基化富含甘氨酸和精氨酸序列(RGG motif);一個蛋白上經常存在多個PRMT7甲基化位點,且這些位點附近氨基酸磷酸化頻率偏高;PRMT7調控的甲基化位點和附近的氨基酸在癌癥中的突變頻率偏高;PRMT7底物中富集與剪接體和RNA調控相關的蛋白。進一步通過對PRMT4和PRMT5底物的鑒定和比較發現,PRMT4、PRMT5和PRMT7甲基組共享一群與mRNA剪接相關的蛋白。RNA-seq分析發現PRMT4、PRMT5和PRMT7共同調控一群和癌癥密切相關的基因可變剪接事件。進一步的機制研究發現,PRMT4、PRMT5和PRMT7能以不同形式共同作用于RNA剪接因子(例如hnRNPA1)并且共同促進其與mRNA前體(pre-mRNA)的結合,從而調控基因可變剪接。
臨床上發現PRMT家族成員在癌癥中經常共表達并且高表達,但其具體的臨床意義不甚清楚。團隊研究證實PRMT4、PRMT5和PRMT7在乳腺癌、結直腸癌和前列腺癌臨床樣品中均呈現高表達,并且PRMTs的高表達和hnRNPA1精氨酸甲基化的富集以及異常的選擇性剪接高度相關。在乳腺癌、結直腸癌和前列腺癌細胞中,PRMT4,PRMT5和PRMT7以及它們介導的hnRNPA1甲基化和剪接異構體能有效促進癌細胞生長。最后,團隊研究發現特異性靶向PRMT4、PRMT5和PRMT7的活性小分子能有效抑制癌細胞的生長,且三者聯合使用具有協同作用,這為相關癌癥治療提供了新的方向和途徑。
廈門大學藥學院劉文教授為文章的通訊作者,課題組博士生李文娟、何耀輝和碩士生楊晶晶為共同第一作者。該研究工作獲得了科技部重點研發計劃,國家自然科學基金,福建省衛生教育聯合攻關計劃,廈門市科技計劃項目,廈門市科技重大專項和中央基本科研業務費等多個項目的經費支持。
論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-021-21963-1
參考資料
[1] 獻禮百年:藥學院劉文教授團隊發文Nature 子刊揭示精氨酸甲基化修飾網絡及有關促癌機制https://pharm.xmu.edu.cn/2021/0330/c19556a429807/page.htm
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