DNA四種堿基中的鳥嘌呤(G)堿基氧化還原性質最為活潑,OH?是生物體內反應活性最強的活性氧自由基,OH?與G堿基的反應在DNA氧化損傷等過程中扮演重要的角色。然而, OH?與G堿基的反應機理仍然存在爭議:普遍接受的加成-脫水機制及最近提出的奪氫-異構化機制。解決爭議的關鍵是區分反應過程中涉及的G自由基中間體(亞氨基dG(N1-H)?自由及氨基dG(N2-H)?自由基)并確定其反應特性。
圖A: OH?與G堿基反應生成dG(N1-H)?自由基的兩種反應機制;圖B:光誘導前體1生成dG(N2-H)?及自由基的anti-和syn-兩種構像; 圖C: 激光光解典型時刻的瞬態紫外-可見吸收光譜; 圖D: 吸收峰分別在610 nm和650 nm的高斯線型擬合anti-和syn-構像的dG(N2-H)?瞬態吸收光譜。
最近,北京師范大學化學學院蘇紅梅老師課題組與美國約翰·霍普金斯大學Marc M. Greenberg教授課題組合作,由設計合成的核苷酸衍生物前體1和苯乙酮光敏反應制備出純凈的dG(N2-H)?自由基,通過時間分辨光譜實時探測自由基的反應過程。在瞬態紫外-可見光譜上觀測到位于610 nm和650 nm的兩個特征吸收峰,結合理論計算分別歸屬為anti-dG(N2-H)? (610 nm)和syn-dG(N2-H)? (650 nm)兩種構像。同時,動力學分析表明伴隨dG(N2-H)?特征吸收峰610 nm和650 nm在幾百μs時間尺度上的衰減,dG(N1-H)?相對于dG(N2-H)?具有較大消光系數的370 nm處的信號卻只有衰減,說明dG(N2-H)?的衰減并沒有對應dG(N1-H)?的生成,排除了dG(N2-H)?在幾百μs時間范圍內異構化生成dG(N1-H)?的可能。研究結果為排除奪氫-異構化機制提供了關鍵的實驗證據,并且首次在瞬態光譜上區分了dG(N2-H)?自由基的anti-和syn-兩種構像,研究揭示了OH?與G堿基等DNA氧化損傷反應中的G自由基中間體的光譜特征和動力學反應機制。該研究工作得到國家自然科學基金委重點基金、杰出青年科學基金、和北京師范大學人才引進專項等項目經費的大力資助,論文近期發表在《Angewandte Chemie International Edition》(Independent Generation and Time-Resolved Detection of 2'-Deoxyguanosin-N2-yl Radical, Angew. Chem. Int. Ed. 10.1002/anie.202005300)
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