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對生長發育和環境適應性至關重要的調控基因在進化過程中具有高度保守性。挖掘關鍵保守基因的方法之一是跨物種比較基因組學分析，該方法減少了物種異質性的影響，并能揭示特定生物過程中的進化保守機制。然而，當前跨物種數據挖掘分析平臺尚不完善，限制了海量多組學數據的應用和關鍵基因挖掘。

該數據庫以模式物種擬南芥同源基因為媒介，將不同園藝作物轉錄組學、表觀組學等數據進行比較，通過交互式分析可快速挖掘到關鍵功能基因。除了跨物種分析（Cross-species analysis），該數據庫還提供了基因表達分析（Gene expression）、物種內比較分析（In-species analysis）、表觀調控分析（Epigenetic regulation）、基因共表達分析（Gene Co-expression）、GO/KEGG分析、進化分析（phylogenetic analysis）等功能模塊，以及BLAST、同源基因查詢和基因序列獲取等實用工具。

迄今，該數據庫涵蓋了40個物種的參考基因組，包含近1.3萬份高通量組學數據。論文以挖掘調控園藝作物采后儲藏保鮮的關鍵基因、鑒定菊花EIN3新功能等示例，展示了該數據庫應用的便利性和有效性。

程華博士和張華博士為該論文共同第一作者，王利凱教授為論文通訊作者。陳發棣教授、陳素梅教授和蔣甲福教授，以及在讀研究生宋憬等參與了該工作。該研究獲國家重點研發計劃等項目資助。