圖1. 光籠5'帽類似物用于光控mRNA翻譯示意圖(圖片來源:Nat. Chem.)
研究背景
信使RNA(簡稱mRNA)是一種參與蛋白質合成的單鏈RNA。mRNA的作用是將蛋白質信息從細胞核中的DNA傳送到細胞質,隨后讀取mRNA序列并將每個三堿基密碼子翻譯成其相應的氨基酸。真核生物mRNA具有特定的 5'帽結構,其通過5'-5'三磷酸橋將N7-甲基化鳥苷連接到第一個轉錄核苷酸。5'帽結構在翻譯起始中起關鍵作用,主要歸因于 N7 甲基化鳥苷對于翻譯起始因子eIF4E的特定識別。同時5'帽對于許多mRNA質控起關鍵作用,并保護真核mRNA免受外切酶降解。mRNA周轉和體內平衡需要專用的去蓋酶(Dcp1-2、DcpS)。5'帽與3'末端的poly(A)尾一起形成mRNA“閉環”,從而促進eIF4E和poly(A)結合蛋白之間的相互作用。沒有5'帽的RNA幾乎不翻譯,并且具有高度免疫原性。因此,用于生物學研究和治療應用的mRNA的生產通常涉及5'-加帽。
圖2. 真核生物mRNA翻譯啟動過程以及化學修飾的位點(圖片來源:Nat. Chem.)
關鍵合成步驟
作者通過在5'端鳥苷N2引入光裂解基團,其中氨基甲酸甲酯作為橋連物可在光作用下有效裂解。以鳥苷為起始反應物,首先使用三甲基甲硅烷基氯化物(Me3SiCl)保護羥基。然后在一鍋反應中,將鳥苷的游離氨基轉化為異氰酸酯,通過與鄰硝基芐基 (ONB) 醇、3,4-二甲氧基- 2-硝基芐基(DMNB)醇、6-硝基胡椒基(NP)醇、6-硝基胡椒基-甲基(NPM)醇反應,形成光可裂解基團或紅移衍生物。之后用氨水(THF溶液)去除TMS基團以獲得光籠鳥苷。然后將光籠鳥苷在5'-OH處單磷酸化以產生圖二中6a,b化合物,甲基化后形成化合物7a,b,并與鳥苷-5'-二磷酸咪唑啉偶聯從而得到最終產物。
圖3. 具有光可裂解基團(FlashCaps)的帽類似物以及光觸發翻譯的整體合成思路(圖片來源:Nat. Chem.)
結構及性能分析
作者進一步分析了N2位置具有光可裂解基團鳥苷的吸收光譜。ONB鳥苷僅在300?nm以上顯示低吸光度,DMNB鳥苷在350?nm處顯示最大吸收,NP和NPM鳥苷略微紅移,在360?nm處達到最大值。為了選擇最適合生物應用的光可裂解基團,作者在中性pH的水溶液中照射并分析它們的減少以及天然鳥苷的形成的HPLC和LC-MS譜圖。結果表明,在365?nm處,短時間照射(5-15?s)足以去除10?μL 500?μM 溶液中的光裂解基團,釋放游離鳥苷。在 405?nm,NP、NPM和DMNB組在60?s后被有效去除,比ONB組更有效。在420?nm,NPM組在120?s后完全去除。因此,作者最終選擇了DMNB和NPM組進行進一步研究,并合成了各自的cap0類似物。生成的FlashCaps在N2位置包含DMNB或NPM基團。它們在300 nm以上的吸收光譜和它們的解籠罩動力學類似于各自的光籠鳥苷。其還還通過在細胞裂解物中孵育cap 0或FlashCaps,然后進行HPLC分析來評估氨基甲酸酯鍵的生物穩定性。FlashCaps在30小時內表現出高穩定性,表明氨基甲酸酯鍵不是裂解液降解的主要點。
圖4. 光可裂解基團 (FlashCaps)基本表征(圖片來源:Nat. Chem.)
隨后,作者評估了光可裂解基團如何影響5'帽與eIF4E的相互作用。在光籠帽存在的情況下,使用微量熱泳(MST)對FlashCaps和Cy5標記的eIF4E的結合測量發現沒有產生結合曲線。在相同條件下,光誘導去除光籠基后,則獲得了與帽0相似范圍內的特征結合曲線和Kd值(0.3?μM),表明帽0有效形成。作者同時還研究了光可裂解基團如何影響與帽修飾酶的相互作用。DcpS是一種焦磷酸酶,可在真核細胞中將帽結構水解為m7GMP和GDP。結果表明,與eIF4E的結果相似,DcpS——一種結合但非切割的脫帽酶變體——與cap0相互作用,但不與FlashCaps相互作用。
圖5. 光可裂解基團 (FlashCaps)修飾的mRNA基本表征(圖片來源:Nat. Chem.)
總結
隨著新冠的大爆發,信使RNA(mRNA)新冠疫苗再次成為研究熱點,其中以Moderna和BioNTech/Pfizer為代表,它們編碼刺突蛋白可有效防止SARS-CoV-2感染。mRNA技術不僅限于疫苗接種,還可改善自身免疫性疾病以及實現個性化的癌癥治療。然而,到目前為止,還沒有策略可以有效實現定時、定點mRNA表達,即在不改變mRNA性能的前提下控制特定組織的遞送和攝取。在本文中,研究人員開發了一種通過光控制mRNA翻譯的技術——FlashCaps。FlashCaps作為mRNA5'帽類似物,通過裂解氨基甲酸酯鍵連接的單個光籠基基團,導致快速有效地釋放天然結構。FlashCap-mRNAs具有以下優勢:(1)僅包含一個光可切割基團;(2)無光照時可暫停蛋白質翻譯;(3)定時、定點釋放天然 cap 0(無帽結構)-mRNA;(4)不改變mRNA自身序列;(5)不具有免疫原性。
圖6. Andrea Rentmeister 教授(圖片來源:Muenster university)
Andrea Rentmeister教授在格拉茨大學和波恩大學獲得化學工程和化學專業博士學位,之后加入加州理工學院弗朗西斯·阿諾德實驗室(2018年諾貝爾獎獲得者)進行博士后研究。2010年成為漢堡大學生物化學初級教授。目前,她在明斯特大學擔任生物分子標記化學教授。致力于了解mRNA翻譯機制并最終控制其特定轉錄及翻譯。開發多種化學和化學酶促方法,對mRNA進行分子水平上操作、分析以及控制,并將其應用于活細胞以及體內。
圖7. Andrea代表奧地利參加2000年夏季奧運會參賽照片(圖片來源:Imago)
文章詳情:
Kl?cker, N., Weissenboeck, F.P., van Dülmen, M. et al. Photocaged 5′ cap analogues for optical control of mRNA translation in cells. Nat. Chem. (2022). https://doi.org/10.1038/s41557-022-00972-7
課題組網頁:https://www.uni-muenster.de/Cells-in-Motion/people/all/rentmeister-a.php
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