吡咯并吲哚天然產(chǎn)物是一大類重要的天然產(chǎn)物,已知成員有數(shù)百種。不同的取代基、立體選擇性和區(qū)域選擇性,構(gòu)成了此類天然產(chǎn)物骨架的多樣性,從而也保障了這類化合物廣泛的生物活性,如抗菌,抗腫瘤,抗瘧原蟲和抑制膽堿酯酶等。部分重要成員已被廣泛地應用于臨床,如治療青光眼和胃動力障礙的physostigmine。鑒于這類天然產(chǎn)物獨特的化學結(jié)構(gòu)和巨大的藥用潛力,備受有機合成和生物合成領(lǐng)域的矚目。
上海交通大學生命科學技術(shù)學院瞿旭東教授課題組,長期致力于吡咯并吲哚生物堿生物合成及其關(guān)鍵酶的功能機制研究。前期解析了C3-芳香型吡咯并吲哚生物堿Naseseazine C的生物合成機制,發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵酶P450(NascB)催化吡咯并吲哚結(jié)構(gòu)的形成 (Nat. Commun. 2018, 9, 4428); 近期,闡明了該類 P450 的催化機制以及對反應的立體和區(qū)域選擇性的調(diào)控機制,通過對關(guān)鍵氨基酸的改造,實現(xiàn)了部分吡咯并吲哚分子骨架的精準合成(Nat. Commun. 2020, 11, 6251);此外,發(fā)展了恥垢分枝桿菌(Mycolicibacterium smegmatis)全細胞催化體系,實現(xiàn)了該類分子骨架的高效生物合成(J. Org. Chem. 2021, 86, 11189)。
本文首先對吡咯并吲哚天然產(chǎn)物的重要性進行了介紹,并根據(jù)吡咯并吲哚C3位置取代基的不同將該類化合物分成了五類:type A (C3-無取代),type B (C3-羥基取代),type C (C3-烷基取代),type D (C3-芳基取代) 和 type E (C3-吡咯并吲哚二聚);隨后,對每類中具有代表性的天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)和生物活性進行了簡要介紹,對生物合成途徑和涉及到的關(guān)鍵酶以及酶學機制進行了詳細介紹;最后對該領(lǐng)域的未來進行了展望,得益于基因組挖掘和蛋白質(zhì)工程的發(fā)展,更多樣的吡咯并吲哚天然產(chǎn)物和后修飾酶將會被發(fā)現(xiàn),同時結(jié)合酶工程改造,有助于高效合成多樣的吡咯并吲哚類似物。
該工作得到國家自然科學基金(31770063和22107069),國家重點研發(fā)計劃項目(2018YFA0900400)和上海市“超級博士后”激勵計劃(2019193)等科研項目的支持。
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