為何新冠病毒奧密克戎變異株的感染性明顯增強(qiáng)?近日,上海科學(xué)家聯(lián)手解析了奧密克戎變異株刺突蛋白及其與受體和抗病毒抗體的復(fù)合物結(jié)構(gòu),從原子水平的微觀視角,解開(kāi)了其感染性增強(qiáng)的謎團(tuán)。相關(guān)論文昨晚在線發(fā)表于國(guó)際著名學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》。
據(jù)世界衛(wèi)生組織最新公布的數(shù)據(jù),全球累計(jì)新冠確診病例近4億例。新冠病毒奧密克戎變異株的出現(xiàn),在全球引發(fā)了新一輪感染高峰。初步研究顯示,奧密克戎變異株的突變位點(diǎn)數(shù)量明顯多于近兩年流行的所有新冠病毒變異株,僅在刺突蛋白的突變就多達(dá)37處,而這些突變?nèi)绾斡绊憡W密克戎變異株的感染性尚不清楚。
去年12月,中科院上海藥物研究所徐華強(qiáng)和尹萬(wàn)超團(tuán)隊(duì)緊急攻關(guān),僅用三周時(shí)間就迅速解析出了奧密克戎變異株刺突蛋白以及結(jié)合人源受體ACE2的高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu)。生化水平結(jié)合實(shí)驗(yàn)顯示,奧密克戎變異株刺突蛋白的受體結(jié)合區(qū)域結(jié)合受體ACE2相對(duì)于野生型有顯著的增強(qiáng),大約提高了近10倍;熱動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)顯示,奧密克戎變異株的RBD高度靈活,而且不穩(wěn)定,這使得刺突蛋白更容易從閉合構(gòu)象向開(kāi)放構(gòu)象轉(zhuǎn)換。
與此同時(shí),科學(xué)家從解析的結(jié)構(gòu)觀察到了奧密克戎變異株刺突蛋白三聚體內(nèi)相鄰RBD特異的相互作用,這可以使奧密克戎變異株的刺突蛋白特定的RBD穩(wěn)定處于開(kāi)放狀態(tài)。這些研究從原子水平解釋了奧密克戎變異株傳染性增強(qiáng)的潛在機(jī)制。同時(shí),解析的結(jié)構(gòu)顯示,奧密克戎變異株刺突蛋白的大部分突變位點(diǎn)位于蛋白表面,包括多個(gè)抗原表位,這從結(jié)構(gòu)上解釋了奧密克戎變異株可抵抗大部分中和抗體的分子機(jī)制。
在此工作基礎(chǔ)上,徐華強(qiáng)和尹萬(wàn)超團(tuán)隊(duì)聯(lián)合藥企科研團(tuán)隊(duì),進(jìn)一步解析了奧密克戎變異株刺突蛋白與特異性治療抗體JMB2002的結(jié)構(gòu)。生化水平結(jié)合實(shí)驗(yàn)顯示,該抗體對(duì)奧密克戎變異株刺突蛋白的結(jié)合力是對(duì)野生型的4倍,顯示出抑制奧密克戎變異株的強(qiáng)大潛力。
科研人員從解析獲得的復(fù)合物結(jié)構(gòu)中發(fā)現(xiàn),JMB2002抗體片段以一種新的構(gòu)象結(jié)合在RBD受體結(jié)合基序的背部,是一種新型作用機(jī)制的中和抗體。目前,該抗體已完成一期臨床試驗(yàn),具有較強(qiáng)的治療效果和較高的安全性。結(jié)合生化和抗病毒中和實(shí)驗(yàn),研究人員闡述了抗體JMB2002具有廣譜抗新冠病毒的分子機(jī)制。
參考資料
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