最近,南京大學化學化工學院左景林教授、丁夢寧教授、馬晶教授等合作,成功制備了含類酶活性中心金屬二硫烯構筑基元的新型金屬有機框架材料,并對其電催化CO2還原性能開展了研究。
近年來,由于化石燃料的廣泛使用,全球CO2排放量逐漸增加,這是全球氣候變暖的主要原因。將CO2轉化成能源物質或者是其它化學品,是目前解決這一問題的主要策略之一。其中,電催化CO2還原反應(CO2RR)是將CO2轉化成可利用能源物質的有效途徑。優異的CO2RR催化劑一般具有以下特征:具有活性催化位點,高選擇性,高效電子轉移速率等。金屬有機框架材料(MOFs)具有可調節的孔徑尺寸和功能化的金屬位點,賦予其良好的CO2氣體吸附能力和高效的催化中心,成為電催化CO2還原反應的理想催化材料。
化學化工學院相關團隊在前期新型電荷轉移金屬配合物研究中取得了一系列重要進展,如利用四硫富瓦烯四苯羧酸配體(H4TTFTB,圖1)與In3+成功合成了穩定性高、氧化還原活性的金屬有機框架材料(Nat. Commun., 2017, 8, 2008; Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 18763)。最近,他們將相關研究拓展到具有類酶活性中心的金屬二硫烯構筑基元上。金屬鎳二硫烯四苯羧酸配體([Ni(C2S2(C6H4COOH)2)2])與四硫富瓦烯四苯羧酸(H4TTFTB)結構和性能相似(圖1),引入的金屬Ni離子取代C=C單元后具有不飽和配位點和新的氧化還原活性金屬中心,從而可能賦予材料更加豐富的物理、化學功能。例如,過渡金屬Mn配位多孔材料具有良好的電化學葡萄糖識別性能(J. Am. Chem. Soc., 2020, 142, 20313)。
圖1 [Ni(C2S2(C6H4COOH)2)2]和H4TTFTB的結構圖
基于以上研究基礎,他們進一步采用氧化還原活性鎳的二硫烯配體[Ni(C2S2(C6H4COOH)2)2]與金屬銦離子反應,制備了具有陰離子骨架的新型MOF結構(圖2),(Me2NH2+){InIII-[Ni(C2S2(C6H4COO)2)2]}·3DMF·1.5H2O (1)。
圖2 MOF 1的結構中含有三種不同的孔道,分別為I(被客體分子占據)、II和III
這類材料具有良好的化學穩定性、熱穩定性和導電性,為進一步電催化應用打下了良好的基礎。此外,MOFs材料保留了[Ni(C2S2(C6H4COOH)2)2]基元可逆的氧化還原活性以及不飽和配位點等優勢,其[NiS4]位點可以有效模擬甲酸脫氫酶和CO-脫氫酶中的二氧化碳還原中心。我們選取同構的MOFs材料1和(Me2NH2+)[InIII-(TTFTB)]·0.7C2H5OH·DMF (2),對它們電化學CO2RR性能進行研究。在研究中,他們發現MOF 1作為CO2RR催化劑不僅能選擇性地將CO2還原為甲酸且大幅提高法拉第效率(FEHCOO-從MOF 2的54.7%提高至89.2%),同時還具有較寬的電壓窗口和長時間穩定性。進一步催化機理研究和密度泛函理論計算結果表明,[Ni(C2S2(C6H4COOH)2)2]基元中的不飽和金屬配位點[NiS4],能夠作為CO2的結合位點和催化位點,賦予1更高的電荷轉移速率、更大的電化學活性面積以及更高的催化活性。這充分說明,鎳的二硫烯配體中[NiS4]金屬不飽和配位點的引入,可以通過類酶途徑有效調控該類材料的電催化活性,為以后設計合成高效穩定的類酶電催化劑提供了新的思路。
相關成果以“In(III) Metal?Organic Framework Incorporated with Enzyme- Mimicking Nickel Bis(dithiolene) Ligand for Highly Selective CO2 Electroreduction”為題,于2021年8月27日在J. Am. Chem. Soc.上在線發表(DOI: 10.1021/jacs.1c06797)。周艷博士和博士生劉盛堂為該論文共同第一作者,博士生顧玉明和溫哥華分別在理論計算以及氣體吸附測試實驗中提供了大力幫助。以上研究工作得到了配位化學國家重點實驗室、介觀化學教育部重點實驗室、人工微結構科學與技術協同創新中心、國家重點研發計劃、國家自然科學基金的支持或資助。
蛋白質在參與機體的生理過程中常伴隨著構象的改變。觀察蛋白質在溶液環境的構象變化和相互作用有助于理解其運行機制且非常具有挑戰性。相比于對體系內總體平均的結果進行分析的集成方法,時間解析的單分子分析技術在研究單個蛋白質的過渡瞬態和復雜的功能機制等方面更具優勢。
單通道納米孔分析技術正在成為無標簽實時分析單個蛋白質的有力工具。它微秒級的時間尺度非常適合蛋白質結構變化的高分辨監測。通過分析單一的蛋白質被捕獲后產生的電流封鎖及其對應的事件時間即可實時反映蛋白質的活動過程。近年來,一系列生物納米孔例如溶細胞素A(ClyA),曲霉毒素C(FraC)和胸膜溶素AB(PlyAB)已被證明可用于研究蛋白質的多種結構動力學。這些生物孔道都具有較大容積的空腔可以完全容納蛋白質分析物,且都經過了一定的工程改造以增加對蛋白質的捕獲效率,這對于納米孔自身的形狀和結構穩定性有較高的要求。
圖1. MspA對鈣調素變構轉換的隨機傳感示意圖
最近,南京大學化學化工學院黃碩團隊報道了一種新的檢測方案,使用錐形結構的恥垢分枝桿菌膜蛋白A (MspA)作為納米陷阱在部分容納待測蛋白的狀態下對其結構進行分析。MspA具有易改造和制備,穩定性強能夠耐受酸堿環境、高溫和高電壓的優點,此前已經被成熟地應用于DNA測序、單分子化學分析和納米孔力譜等方面。該篇工作也是MspA納米孔首次系統地應用于蛋白質-配體結合以及病理學突變相關的蛋白構象變化的無標記檢測,展現出了極佳的靈敏度和分辨率(圖1)。
圖2. apo-wtCaM、Ca-wtCaM和M13-Ca-wtCaM捕獲的單分子特征
該工作選擇鈣調素(CaM)作為該策略的研究對象,對其三種構象異構體進行了全面的實驗表征研究(圖2),證明了MspA納米陷阱能夠直接區分鈣調素的構象變化。同時,作者也進行了單個氨基酸病理突變型的結構研究(圖3),首次從單分子尺度發現致病突變D129G引發鈣調素功能變化是由部分結構域失去了結合鈣離子的能力,引起的結構失調所導致的。
圖3. 病理學突變型CaM-D129G捕獲的單分子特征
作者還評估了不同離子(Mg2+/Ca2+/Sr2+/Ba2+/Pb2+)對鈣調素功能的競爭關系,通過實時監測離子結合產生的不同別構狀態之間的比例進行了系統的單分子研究,獲得了結合能力的排序。值得注意的是,鈣調素與金屬離子充分結合時具有相同的結構,表現為平均阻孔電流相似,但仍然可用阻塞電流波動差異很好地區分開,證明不同離子結合鈣調素后蛋白質結構波動不同,這是本研究中首次報道的一種現象。最后,作者使用MspA實時檢測了由Tb3+結合引起的鈣調蛋白的聚集過程并與Ca2+對比,首次捕獲到了鈣調素和Tb3+結合的一個中間態,揭示了Tb3+作為Ca2+的熒光替代物用于研究鈣結合蛋白的局限性。該工作證明了MspA作為傳感器對蛋白質結構變化的高度敏感性和巨大潛力,為納米孔蛋白質分析提供了新選擇。
圖4. 鈣調素在不同二價離子存在下的結構分析
該工作以“Allosteric Switching of Calmodulin in a Mycobacterium smegmatis porin A (MspA) Nanopore-Trap“為題,于2021年8月27日發表于《德國應用化學》(文章鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202110545,DOI: https://doi.org/10.1002/anie.202110545 )。南京大學化學化工學院博士生劉瑤為該論文第一作者,黃碩教授為論文通訊作者,陳洪淵院士對該工作做出了重要指導。此項研究得到了生命分析化學國家重點實驗室以及南京大學化學和生物醫藥創新研究院(ChemBIC)的重要支持。國家自然科學基金(項目編號:31972917, 91753108, 21675083)、江蘇省高層次創業創新人才引進計劃(個人、團體計劃)、江蘇省自然科學基金(項目編號:BK20200009)、南京大學生命科學分析化學國家重點實驗室(項目編號:5431ZZXM1902)、南京大學科技創新基金資助項目等經費支持。
參考資料
聲明:化學加刊發或者轉載此文只是出于傳遞、分享更多信息之目的,并不意味認同其觀點或證實其描述。若有來源標注錯誤或侵犯了您的合法權益,請作者持權屬證明與本網聯系,我們將及時更正、刪除,謝謝。 電話:18676881059,郵箱:gongjian@huaxuejia.cn